El museo ofrece varias opciones gastronómicas dentro de sus terrenos. Hoteiya, un restaurante tradicional japonés, sirve cocina japonesa de temporada en un entorno elegante y requiere reserva previa para el almuerzo. El Museum Garden Café funciona durante la primavera y el otoño, cuando el jardín está abierto, ofreciendo comidas ligeras y refrescos. Para una comida más informal, hay una cafetería en el Honkan que sirve café, té y aperitivos ligeros. Además, la tienda y café del museo cerca del Heiseikan ofrece bebidas y alimentos sencillos. Fuera del museo, Ueno Park cuenta con numerosos restaurantes y cafeterías, y el barrio circundante de Ueno ofrece amplias opciones gastronómicas para todos los presupuestos.
