Sí, Yubatake Souan cuenta con baños termales onsen, tanto interiores como exteriores, con aguas naturales ricas en minerales procedentes de las famosas aguas termales de Kusatsu. El ryokan ofrece baños públicos separados por género y algunas habitaciones pueden incluir instalaciones privadas de onsen, permitiendo a los huéspedes disfrutar de los beneficios terapéuticos de las aclamadas aguas termales ácidas de Kusatsu.